湘湖实验室再添硬核成果
罗氏沼虾育种新型芯片研发成功
日期:12-20
本报讯(首席记者 何可人 通讯员 吴琼)近日,湘湖实验室淡水水产核心种源创制团队联合华智生物技术有限公司,在罗氏沼虾育种技术领域取得新突破——成功研发“湘湖科芯2号”10K低密度液相分型芯片。该芯片在前期100K高密度液相分型芯片基础上迭代升级,以更高效、更经济的优势,为罗氏沼虾大规模全基因组选择育种提供全新工具,助力水产核心种源创新与产业高质量发展。
作为针对性解决育种实际需求的技术成果,“湘湖科芯2号”在位点设计上实现精准突破,兼顾全基因组覆盖广度与功能筛选精度。芯片以100K高密度液相分型芯片中筛选出的9567个分布均匀、信息量足的位点为核心骨架,奠定分型稳定性基础;同时精准整合功能导向关键位点,新增2834个生长性状与抗病性状基因组选择模型中效应值TOP1%的核心位点,融入团队前期挖掘的91个与体长、体重、虹彩病毒抗性、低蛋白饲料耐受性等经济性状显著相关的GWAS位点,去重后共包含12471个高质量SNP位点,实现了结构覆盖与功能信息的有机统一,为育种筛选提供精准数据支撑。
湘湖实验室淡水水产核心种源创制团队相关负责人介绍,相较于传统100K高密度液相分型芯片,“湘湖科芯2号”最大亮点在于“降本不减效”。使用该芯片分型,结合基因型填充算法,能大幅降低单个样本分型成本,同时保持位点分布均匀性与效应值估测精度。分型成本的降低,可轻松扩大分型群体规模,不仅能提升基因组选择筛选精度,获得最大化的群体遗传进展,还能有效管控近交风险,为罗氏沼虾分子育种体系优化筑牢技术根基。
目前,该芯片可广泛应用于群体遗传评估、亲缘关系校正、最优选配设计等育种关键环节,将推动罗氏沼虾育种从传统模式向高效分子模式跨越,切实保障水产养殖产业优质种源供给,提升产业核心竞争力。未来,湘湖实验室将持续深耕淡水水产种源创制领域,加速技术成果转化落地,为水产养殖产业升级持续赋能加码。