1988年，位于秋涛路407号的汽车南站建成使用。
2002年9月，汽车南站按照一级站标准改、扩建，主要承担浙南方向公路旅客的运输任务，班车辐射杭州地区、温州地区、金华地区、丽水地区以及江西和福建等地。
2011年，车站日均发送班次近500班，进出旅客达1.1万余人次，国庆最高峰日进出旅客达10万余人次。
2019年7月1日，搬迁至汽车南站临时客运站营业，同时部分班线分流到火车东站公路汽车站、客运中心站和汽车北站营业。
2021年11月28日，历经搬迁，位于婺江路455号的杭州汽车南站启用。
火车东站汽车站
客运中心站
原有班线将分流到这里
杭州汽车南站关停后，原有班线将依据原线路走向，以方便旅客乘车为原则进行线路调整。具体线路调整情况如下：
发往绍兴、金华、衢州（部分班线）、丽水、宁波、嘉兴及江西（部分班线）、福建的班线，分流至杭州火车东站汽车站。
发往萧山机场、舟山、衢州（部分班线）及江苏、安徽、江西（部分班线）的班线，分流至杭州客运中心站。
已经开通的桐庐、建德方向城际站点巴士，分流至杭州火车东站汽车站始发。
乘客可通过“杭州长运”微信公众号、“长运伴你行”微信小程序、“滴滴出行”微信小程序或app，点击“站点巴士”选择线路和就近的站点购票乘车。
若对此有任何疑问，请联系咨询热线0571-86075352或0571-86046666。
本报记者 胡大可 陈薇