卫所，是明朝设立的带有军事性质的地理单位。洪武年间，明廷在全国各军事要地设立军卫，分“卫”“所”两级建制——5600人为卫，1120人为千户所，112 人为百户所。官兵以家庭为单位居于卫所，实行世袭制。明太祖朱元璋对这种“寓兵于农”的制度很是得意，曾自矜曰：“吾养兵百万，不费百姓一粒米。”永乐年间全国有493个卫, 359个千户所。随着卫所军户人口的繁衍，从明代中期开始，其军事色彩逐渐消退。到清雍正年间改革行政区划时，卫所制度被彻底废除。但改设为府、厅、州、县的一些卫所，其地名则留下了当年的历史痕迹。
《明史·地理志》记载了一些都司卫所的名称。例如在今辽宁境内的沈阳中卫（今沈阳）、铁岭卫（今铁岭）、宁远卫（今兴城）、广宁中后所（今绥中）、抚顺所（今抚顺）；在今宁夏（时属陕西）的宁夏中卫（今中卫）、灵武所（今灵武）；在今青海境内的西宁卫（今西宁）、归德所（今贵德），等等。
今青海省会西宁市就源于卫所。明洪武六年（1373），设西宁卫，取义为“西陲安宁”，辖地甚广。清雍正二年（1724），西宁卫改设西宁府，首县为西宁县，到民国三十四年（1945）撤销西宁县，设立西宁市。
在明代，宁夏是军事重镇之一，驻军达7万余人，仅宁夏平原就有156个驻军堡寨。按今行政区划，宁夏南部设固原镇，北部则为宁夏镇，在“九边重镇”里，宁夏独占其二。其中的宁夏镇下辖七卫（宁夏卫、宁夏前卫、宁夏左屯卫、宁夏右屯卫、宁夏中屯卫、宁夏后卫与宁夏中卫）。至清雍正年间，大部分卫所或废弃或改名，唯独宁夏中卫改制成县，直称“中卫县”，地名留存至今。
辽宁抚顺在明朝是“千户所”。洪武十七年（1384），明军建抚顺城，隶属辽东都指挥使司沈阳中卫。抚顺虽小，但地理位置十分重要，它是当时辽东城（辽阳）以东的边防重镇，是明朝与女真“建州三卫”往来的要冲。在明朝辽东都指挥使司下辖的25卫里，不乏后来成为城市的例子，如海州卫就是今海城市。
大同市左云县位于山西省北部，与内蒙古毗邻。明代将大同北卫与川云右卫合并，置左云川卫。清代先置左云卫，后设左云县。大同市阳高县，西汉置高柳县，明洪武年间置阳和卫，明宣德年间迁高山卫来此。清初改为阳高卫，后设阳高县。山西省朔州市右玉县，明永乐年间将玉林卫并入右卫，改称右玉林卫。清初更名右玉卫，后设右玉县。
始建于明洪武年间的万全右卫城，位于河北省张家口市万全区，因战略地位重要，得名“万全”。万全右卫城作为外长城的重要节点，是抵御外敌、保卫京师的前哨阵地，也是明代长城军防体系的重要一环。随着边关战事缓和，商贸活动兴起，遂使此处逐渐发展为繁华的商贸中心，呈现出干戈化玉帛的民族融合气象。