在重庆南开学校读书的六年，齐邦媛和同学们是在战火中度过的。跑警报的日子，刻骨铭心。
“一九三九年春天以后，日本飞机加强轰炸重庆，除了下大雨，天天来。……重庆四周高山之上设立许多防空监视哨，空袭时便在哨前长杆上挂起一只红色灯笼，并且响起一长一短的空袭警报。敌机侵入一定范围之内，再挂一只红色灯笼，接着响起紧急警报，急促的一长一短的警报响彻山城内外。”
在《巨流河》一书中，齐邦媛清楚地记得夜间如何跑警报。“南开中学因为建在郊区，所以规定全体学生住校。”“女生宿舍每一间有十八张木板床，三排各六张，中间只容一人行走。”齐邦媛戏称那是有着18张床的闺房。跑警报的时候，她和室友们都是“由睡梦中惊醒立刻下床，扎上腰带穿鞋逃命，那样的惶惑和愤怒，延续数年的警报声，在我心上刻画了深深的伤口，终生未能痊愈”。
“南开没办法在平地上修防空洞，只能在空袭警报时立即疏散，每次周会就领学生念口诀：‘一声警报，二件衣裳，三人同行，四面张望……’我们女中教室后面是一些小小的沙丘，像千百个狐穴，跑出去时就三人找一丘靠着。……烽火烧得炽热，炸弹声伴着我们的读书声。不跑警报的时候，埋首用功；跑警报时，课本仍然带着，准备明天的考试。”
“初中时期思想单纯，常在疏散四郊时讲一讲课本上的难题。虽然害怕，有时觉得不上课（尤其早上的数学课）出去跑跑也很有趣。但是，跑掉的课都会在昏昏欲睡的晚自习时补上。”
齐邦媛在回忆录中还清楚地记载了1941年6月5日和8月7日，日军对重庆两次疯狂轰炸的情形。“一九四一年六月五日，日寇飞机夜袭重庆市，校场口大隧道发生窒息惨案，市民死伤约三万余人。……隧道内市民多已在窒息之前自己撕裂衣服，前胸皮肉均裂，脸上刻满挣扎痛苦，生还者甚少。……这段历史上不容漏载的国仇，我至今仍感愤怒悲伤。”
“一九四一年八月七日，日机开始对重庆进行日夜不停的疲劳轰炸。……日以继夜，无六小时之间隔。重庆市内饮水与灯光皆断，人民断炊。无家可眠。”
“长长的八年，在自己的国土上流离，没有安全感，连蓝天上也是暴力，怎能忘怀？”