南京调查江豚首次应用数字PCR技术

近日，江苏省南京环境监测中心（以下简称“南京中心”）结合江苏长江生态质量综合监测站建设，首次运用数字PCR技术成功开展了江苏长江干流典型江段江豚调查研究。结果显示，长江江豚环境DNA检出率达到90%，其中南京新济洲、大胜关、中山码头以及扬州三江营、泰州靖江等江段浓度较高，与人工野外观察确定的江豚活跃区域高度吻合。此次监测的成功，为今后精准划定江豚重点保护区域提供了全新高效的技术路径，也标志着南京市水生态监测专项实验室建设取得重要进展。

据了解，南京中心一直紧跟环境DNA技术发展前沿，累计投入1300余万元打造水生态监测专项实验室，配备包括高通量测序仪、正置、倒置、体式显微镜、藻类AI鉴定系统等36类49台先进设备，构建了从采样到分析的全流程分子生物学监测平台，为该技术的研发与应用提供了强大支撑。

近三年来，生态监测团队持续投入环境DNA能力建设与方法优化，通过大量实验不断调整和验证检测流程。针对不同样本在相同实验条件下结果差异大的难题，技术人员对原方法进行多轮优化，成功突破复杂环境样本的分析瓶颈。2023年6月，实验室首次独立完成地表水样品中鱼类环境DNA的高通量测序，Q30（碱基准确度为99.9%）超过90%，意味着实验室在该领域实现关键突破。

随后，实验室于2023年8月完成三轮鱼类环境DNA测序，累计检出刀鲚、兴凯鱊、银鲴、三角鲂等40种鱼类；至2024年底，通过该技术在南京地区检出鱼类108种；2025年7月，这一数据更新至110种。不断增加的物种数，反映出南京地区鱼类多样性认知正变得更为全面和精确。

2024年初，实验室依据中国环境监测总站标准样品开展盲样测试，5种目标鱼类全部准确检出。此后，南京中心启动水生生物条形码数据库建设，通过DNA测序完成180多个样本鉴定，涵盖底栖动物90余种，为物种识别建设了一套可靠的“分子身份图鉴”。

在近期开展的长江江豚调查中，技术人员仅用一周时间就完成阳性样本的PCR扩增实验，将数字PCR技术与野外实地观测相结合，精准锁定江豚活动热点区域。

2025年4月，南京中心与中国环境监测总站共同推动的《淡水鱼类环境DNA监测技术规范》和《淡水底栖动物环境DNA监测技术规范》两项预研究项目通过开题论证，为相关方法的标准化应用奠定基础。

南京中心将不断强化环境DNA技术能力建设，优化实验方法，扩大采样范围，完成两项预研究标准研究，同步持续开展长江江苏段旗舰物种及区域指示性物种监测，推动传统形态学调查与环境DNA技术深度融合，实现“1+1＞2”的协同效应。

南京晨报/爱南京记者 刘通