城市轨道交通是城市地下空间开发利用的重要引擎，也是发展公共交通、解决地面交通拥堵的必要手段。蓝皮书显示，江苏省已开通轨道交通的城市中，南京地铁公共交通分担率已达65.5%，位居首位。
地铁7号线是南京首条采用全自动无人驾驶技术的地铁线路，起自西善桥站，终至仙新路站，共设车站27座。北段（幕府西路站至仙新路站）已开通运营，南段（西善桥站至应天大街站）已开通初期运营，中段已完成所有围护结构和主体结构，正在施工附属结构。
目前，南京地铁11条线共建。其中，续建线路8条，分别为3号线三期、4号线二期、5号线、6号线、7号线中段、9号线一期、10号线二期和11号线一期，持续加密市域轨道交通线网；市域线路3条，分别为宁马线、宁滁线和宁扬线，加快构建“轨道上的都市圈”。