2005年2月，江苏省委、省政府综合泰州医药产业基础以及国内外医药产业发展趋势，作出了在泰州“设立医药产业园、打造中国医药城”的重大战略决策。

2006年11月，医药产业园正式启动建设。

2007年，成立省级泰州医药高新区（整合医药产业园、泰州经济开发区、出口加工区等资源）。

2009年3月，国务院批复泰州医药高新区升级为国家级高新区，成为全国第一个以医药产业定位命名的高新区。

2010年2月，科技部、卫生部、国家食品药品监管局、国家中医药管理局与江苏省政府共建中国医药城机制正式启动，成为全国唯一的部省共建高新区。

2021年6月，医药高新区与高港区启动融合发展，生物医药产业园区成为医药高新区（高港区）所属园区之一。