长汀卧龙书院始建于南宋绍定年间，为汀州史籍明文记载最早的一所书院。南宋时期修撰的地方志《临汀志》记载：“卧龙书院，清堂之左，旧名卧龙堂。”旧址在汀州府治内，因背靠卧龙山而得名，同时也寓意书院的学子们像卧龙一样学业有成后蓄势腾飞。
重建的卧龙书院，参照有关史料记载重新选址建设，于2015年开始启动，历时近5年时间完成。书院占地面积约20亩，建筑面积6700多平方米，取址在三元阁以南，汀州城的中轴线上，与北面的汀州试院遥相呼应。
书院照壁上的“进德”二字雄浑厚重、气势宏大，意指求学的首要目的是增进品德，这也是书院的“校训”，进德修业是书院的宗旨，进德是第一位的。走进院内，5栋古建筑错落有致，书院里最大的一幢建筑是讲坛。讲坛是书院的核心建筑，是书院的传道授业之地。讲坛正中牌匾上的“明伦”二字由朱熹所题，意为通过学习明白伦理道德的规范。
走进后厅，看到圆顶的天窗，与屋顶八角的木雕搭配出一幅精美的八卦图。这里的天窗不仅通风、透气、采光，还有聚财之说。后厅的天井是圆形而前厅的天井是方形，体现了古人天圆地方的理念。屋顶下方精美的横梁木雕，分别雕刻有《三国演义》的张松献地图、当阳长坂坡、空城计，《封神演义》中姜太公钓鱼等故事内容，栩栩如生，活灵活现。
从讲坛出来后，沿着木廊就到了藏经楼。厅内正中上方悬挂题写着“文章阴骘”四字的牌匾，意指通过读书学习明白事理让内心沉静安定。
藏经楼的斜对面是一栋由成龙先生捐赠的徽派古建筑，名为龙学馆。往东来到求真馆，馆内设有朱熹馆，介绍“理学与汀州”的渊源：汀州人杨方心慕朱熹，时值调弋阳当县尉，不赴任，而是前往崇安几个月，得到朱熹面授学成而归。随后，杨方在汀州传播理学，广收门徒，推动汀州理学发展。馆内还设有王阳明馆，介绍的是“心学与汀州”的渊源：清乾隆版《汀州府志》载，“王守仁，余姚人，正德年间为虔州巡抚，贼首詹师富等负隅山洞，守仁提师过汀往剿。汀人感德，所过皆立祠祀之”。在汀城三元阁东侧建有一座“王文成公祠”，这是明朝崇祯年间为纪念王阳明而建造的。
求真馆对面是文昌阁。从外观看有五层，实则三层，飞檐翘角，雕梁画栋，在层檐灯带的映衬下金碧辉煌。步入一楼，但见正堂之上供奉着万世师表的孔子像，堂内左右墙上各有孔子8位弟子的画像。二楼供奉的是文昌帝君像，相传掌管人间文运。三楼供奉的是魁星像，相传掌管科举考试。客家人历来推崇教化，重视科考，在书院里重建文昌阁，是汀州兴文风的延续。