闽台文化是中华文化的一部分，两地文化渊源深厚。明末清初，随着大量福建移民迁到台湾，闽台形成了共同的文化区。儒家学说作为中华文化的主干，在闽台文化的传承和交融中起到主导作用。宋代，朱熹集理学大成，创立闽学。清统一台湾后，提倡有利于安定社会、注重个人道德修养的闽学。闽台儒学这种源与流的关系，对台湾的政治、经济、文化都产生了深刻影响。
该部分展品包括与闽台交流相关的文学作品、书法作品和美术作品，如余光中手写诗稿的复制件。