据人民网报道 赖清德当局上台以来，严查台岛民众申领大陆户籍。据台媒报道，目前约有50人台湾户籍被废止，16名大陆籍配偶在台“移民署”介入后决定放弃台湾身份。
台媒称，赖清德今年抛出所谓“17项策略”，包括清查“违规”设籍或持有大陆身份证者；一旦查证台湾民众持有大陆身份证，将注销其台湾身份，并通知相关单位取消台湾健保、身份证件等。台“移民署”在进行项目清查后，2日确认台湾约有1.2万名当事人被要求补缴“丧失原籍证明”，至今已有7835人提交，因疾病等不可抗力因素具结延期提交者2317人，长期出境在外者经列册管理1388人。台“移民署”称，今年元旦以来，约有50人经调查确认“两地设籍事证明确”，已通报台当局户政机关废止他们的台湾户籍；另有16名陆配放弃台湾身份。据台媒报道，此次除籍名单中，不乏台湾知名人士在列，包括跆拳道选手李东宪、教师张立齐等。
台湾方面陆委会还扬言，明年元旦起，“军公教”核心人员应配合各机关和学校，办理常态化、制度化查核，不得在陆设籍、申领持用大陆相关身份证件；查核对象涵盖公务体系职员、法官、检察官等，连约雇人员、驻卫警、工友和司机都列入，不配合查核者将面临不得聘用等处置。
国台办发言人朱凤莲8月27日在例行记者会上表示，民进党当局刻意针对在台定居落户多年甚至20多年的陆配，在早已超过追溯期的情况下要求他们限期补缴所谓“丧失原籍证明”，这是典型的滥权妄为、与民为敌的行为，其目的是制造“两国论”，为“台独”分裂服务。她说，大陆公安机关始终依法依规处理有关居民户籍事宜，为百姓排忧解难，但绝不意味着会助纣为虐。除非民进党当局承认一个中国原则，以台湾省名义向各省区市主管部门提出请求，否则大陆方面不会接受民进党当局提出的此类所谓请求。
台湾青年联合会理事长何溢诚撰文称，台当局“高设门槛分明强人所难”，无论是陆配，还是去大陆求学求职经商的台生、台干、台商，本都是台湾家庭重要成员，多半安分守己，为两岸经济社会发展作贡献，却被民进党区别、歧视对待。民进党当局意图通过杀鸡儆猴，使“反独促统”声音消失，“严重破坏百姓家庭的正常生活，徒生社会不安”。