1、头颈肿瘤科（放射治疗和药物治疗一体化融合型亚学科）：
负责头颈（鼻咽癌、口咽癌、口腔癌、下咽癌、喉癌等）、中枢神经（胶质瘤、脑膜瘤、室管膜瘤、髓母细胞瘤、颅咽管瘤、脊索瘤、脊髓肿瘤等）肿瘤；
2、食管与胃肿瘤科（放射治疗和药物治疗一体化融合型亚学科）：
负责食管、胃、纵膈（胸腺等）肿瘤；
3、乳腺肿瘤科（放射治疗和药物治疗一体化融合型亚学科）：
负责乳腺、软组织、骨、皮肤及恶性黑色素肿瘤；
4、肺肿瘤与淋巴瘤科（放射治疗和药物治疗一体化融合型亚学科）：
负责肺癌、淋巴瘤及多发性骨髓瘤；
5、肠与肝胆胰肿瘤科（放射治疗和药物治疗一体化融合型亚学科）：
负责结直肠、肝胆、胰腺肿瘤；
6、妇科与泌尿肿瘤科（放射治疗和药物治疗一体化融合型亚学科）：
负责妇科（宫颈癌、子宫内膜癌、卵巢癌、阴道癌、外阴癌等）、泌尿（前列腺癌、肾癌、输尿管癌、膀胱癌等）、生殖（睾丸肿瘤、妊娠滋养细胞疾病等）肿瘤。